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Référence
SL-DRF-24-0492
Direction
DRF
Description du sujet de thèse
Domaine
Sciences du vivant
Sujets de thèse
Les protéines de type prion dans le plancton marin: à la recherche de nouveaux facteurs moléculaires de l’adaptation aux changements de température
Contrat
Thèse
Description de l'offre
Le changement climatique remodèle la répartition des espèces sur la planète et les mécanismes d’adaptation au stress thermique sont alors sollicité. Récemment, chez les plantes terrestres le rôle des protéines de type prion a été mis en évidence dans les mécanismes de floraison et de vernalisation. Ces protéines atypiques n’ont cependant pas été recherché dans le monde marin où le plancton joue un rôle essentiel dans la pompe à carbone biologique et le réseau trophique marin. Pour explorer le monde des protéines de type prion et leur rôle dans l'adaptation aux changement de température des espèces planctoniques marines, nous proposons un programme de doctorat de trois ans au sein de l'équipe de biologie computationnelle du CEA-SEPIA à l'Institut de biologie François Jacob situé à Fontenay-aux-Roses, France. Le premier objectif est d'identifier et de caractériser la fonction des protéines marines de type prion ainsi que leur biogéographie dans les océans du monde. Le doctorant reconstruira également l'évolution moléculaire de ces protéines à travers un large spectre d'espèces de plancton marin grâce à des analyses de gain/perte de gènes et de signaux d'adaptation moléculaire. L'approche de recherche s'appuiera sur la génomique et la phylogénie comparatives à partir des données métagénomiques et métatranscriptomiques de Tara Oceans. De plus, l'étudiant identifiera des protéines de type prion impliquées dans l'adaptation aux changements de température en intégrant les données spatiales et environnementales collectées par les expéditions Tara Oceans. Dans un contexte du changement climatique actuel, cette recherche s’intègre dans la compréhension de l’évolution moléculaire des protéines de type prion, éclairant leur rôle dans l’adaptation d’espèces jouant un rôle clé dans les écosystèmes marins.
Université / école doctorale
Structure et Dynamique des Systèmes Vivants (SDSV)
Paris-Saclay
Localisation du sujet de thèse
Site
Fontenay-aux-Roses
Critères candidat
Formation recommandée
M2 bioinformatique
Demandeur
Disponibilité du poste
01/09/2024
Personne à contacter par le candidat
MADOUI Amin mohammedamin.madoui@cea.fr
CEA
DRF/JACOB//LIDT
18 Route du Panorama
92265 Fontenay-aux-Roses
0146548105
Tuteur / Responsable de thèse
MADOUI Amin mohammedamin.madoui@cea.fr
CEA
DRF/JACOB//LIDT
18 Route du Panorama
92265 Fontenay-aux-Roses
0146548105
En savoir plus
https://madoui.github.io/
https://jacob.cea.fr/drf/ifrancoisjacob/pages/departements/sepia.aspx