Informations générales
Entité de rattachement
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Les 20 000 collaboratrices et collaborateurs du CEA partagent trois valeurs fondamentales :
• La conscience des responsabilités
• La coopération
• La curiosité
Référence
SL-DRT-24-0567
Direction
DRT
Description du sujet de thèse
Domaine
Défis technologiques
Sujets de thèse
Conception d’un nouveau microscope light-sheet pour le suivi temporel d’organoïdes sur puce
Contrat
Thèse
Description de l'offre
Nous proposons dans cette thèse de développer un système de microscopie de fluorescence light-sheet pour caractériser optiquement des organoïdes en 3D et en carte microfluidique. La thèse se concentrera sur la mise au point d’un light-sheet miniaturisé et multi longueur d’onde, qui marche directement dans un incubateur cellulaire et qui pourra être utilisé pour la visualisation et le suivi morphologique/fonctionnel d’objets 3D optiquement complexes et diffusants. Le début du travail sera de bien comprendre l’impact de la miniaturisation sur la mise en forme du faisceau d’excitation à différentes longueurs d’onde et sur la qualité des images. Ensuite, la mise en forme du faisceau d’excitation pour aller le plus profondément possible dans l’échantillon biologique d’intérêt sera évaluée. Le système sera ensuite caractérisé en incubateur pour le suivi temporel des organoïdes sur puce et la caractérisation du système biologique vivant. Nous nous concentrerons principalement sur deux échantillons : des organoïdes pancréatiques en puce microfluidique et des organoïdes de cerveau en 3D. L’objectif sera de réaliser une imagerie pour permettre, en collaboration avec les biologistes, un suivi temporel de marqueurs spécifiques en fluorescence directement dans un incubateur cellulaire. Ce travail nous permettra de proposer des pistes d’intégration de fonctions optiques à l’intérieur d’une carte microfluidique pour le suivi 3D morphologique et fonctionnelle d’organoïdes sur puces.
Université / école doctorale
Ecole Doctorale de Physique de Grenoble (EdPHYS)
Université Grenoble Alpes
Localisation du sujet de thèse
Site
Grenoble
Critères candidat
Formation recommandée
Master 2 ou Diplome d'ingénieur en optique / biophotonique
Demandeur
Personne à contacter par le candidat
PAVIOLO Chiara chiara.paviolo@cea.fr
CEA
DRT/DTBS//L4IV
Commissariat à l’énergie atomique et aux énergies alternatives / LETI
MINATEC Campus
17 rue des martyrs
F-38054 Grenoble Cedex
0438786348
Tuteur / Responsable de thèse
BLANDIN Pierre pierre.blandin@cea.fr
CEA
DRT/DTBS//PREMS
Commissariat à l’énergie atomique et aux énergies alternatives / LETI
MINATEC Campus
17 rue des martyrs
F-38054 Grenoble Cedex
0438783465
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