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Référence
SL-DRF-24-0519
Direction
DRF
Description du sujet de thèse
Domaine
Sciences du vivant
Sujets de thèse
Localisation et dynamique des protéines clés associées au nucléoïde au cours du remodelage du nucléoïde bactérien induit par le stress.
Contrat
Thèse
Description de l'offre
Le remodelage, et en particulier, la compaction de nucléoïdes, est un mécanisme commun de réponse au stress chez les bactéries, qui leur permet de réagir rapidement aux changements soudains de leur environnement. Par des approches de microscopie optique avancées, nous avons récemment suivi les changements de morphologie et de volume des nucléoïdes induits par l'exposition au rayonnement UV-C dans la bactérie radio-résistante, Deinococcus radiodurans. Ce processus en deux étapes implique une condensation initiale rapide du nucléoïde suivie d'une phase de décompaction plus lente pour restaurer la morphologie normale du nucléoïde, avant que la croissance et la division cellulaires ne puissent reprendre. Les protéines associées aux nucléoïdes (NAP) sont connues pour être des acteurs clés de ce processus, bien que les détails de leur implication restent encore peu décrits. Nous avons commencé à faire la lumière sur le rôle central de la principale NAP, la protéine HU, dans ce processus. Le projet de thèse que nous proposons prévoit d'étendre ce travail à 5 autres NAPs impliquées dans le processus de remodelage des nucléoïdes induit par le stress. Le/la doctorant(e) effectuera des études biochimiques pour suivre l'abondance de ces facteurs clés, de la microscopie de fluorescence pour cartographier leurs distributions et du suivi de particules uniques pour déterminer leurs dynamiques. Ces travaux nous permettront d'approfondir nos connaissances sur les processus fondamentaux qui régissent l'organisation du génome bactérien et comment ils sont affectés par le rayonnement UV et les dommages à l'ADN.
Université / école doctorale
Chimie et Sciences du Vivant (EDCSV)
Université Grenoble Alpes
Localisation du sujet de thèse
Site
Grenoble
Critères candidat
Formation recommandée
Titulaire d’un Master en biologie ou biophysique. Excellents résultats universitaires. Intérêt marqué pour les technologies d'imagerie ainsi que l’analyse d’images. Bonus : Expérience en microbiologie et/ou biochimie.
Demandeur
Disponibilité du poste
01/10/2024
Personne à contacter par le candidat
TIMMINS JOANNA joanna.timmins@ibs.fr
CNRS
Institut de Biologie Structurale (IBS), UMR 5075 UGA,CNRS,CEA
71 AVENUE DES MARTYRS
CS 10090
38044 GRENOBLE CEDEX 9
04 57 42 86 78
Tuteur / Responsable de thèse
TIMMINS JOANNA joanna.timmins@ibs.fr
CNRS
Institut de Biologie Structurale (IBS), UMR 5075 UGA,CNRS,CEA
71 AVENUE DES MARTYRS
CS 10090
38044 GRENOBLE CEDEX 9
04 57 42 86 78
En savoir plus
https://www.ibs.fr/fr/recherche/assemblage-dynamique-et-reactivite/groupe-imagerie-integree-de-la-reponse-au-stress/?lang=fr
https://www.ibs.fr/fr/recherche/assemblage-dynamique-et-reactivite/groupe-imagerie-integree-de-la-reponse-au-stress/equipe-genom/