L’OMS a identifié la résistance aux antibiotiques comme étant l’une des menaces majeures pour la santé humaine. Selon les prédictions, le nombre de décès en lien avec l’antibiorésistance est estimée à 10 millions par an en 2050. Cette situation amène les scientifiques à trouver de nouvelles molécules, idéalement naturelles, dont la structure et le mode d’action diffèrent par rapport aux antibiotiques conventionnels, pour pallier les phénomènes de résistance. Une alternative prometteuse concerne les peptides antimicrobiens de la famille des RiPPs (ribosomally synthesized and post-translationally modified peptides) produits par des bactéries. De nombreux travaux montrent que le microbiome intestinal joue un rôle très important dans la santé de l’hôte. Parmi les mécanismes mis en œuvre, la production de peptides antimicrobiens apparait importante. Une partie de nos travaux, menés en collaboration, vise à identifier des nouveaux peptides antimicrobiens issus d’écosystèmes biologiques complexes par des méthodes de métagénomique. A ce jour, nous avons identifié une dizaine de séquences potentiellement intéressantes. Dans ce projet, nous nous intéresserons à la biosynthèse des peptides antimicrobiens ainsi qu’à leur caractérisation biochimique et structurale. Une partie importante du sujet sera consacrée à l'activité biologique de ces composés sur des pathogènes résistantes et multi-résistants aux antibiotiques conventionnels. Le mode d'action ainsi que la toxicité seront abordés pour les peptides les plus efficaces