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Référence
SL-DRF-24-0550
Direction
DRF
Description du sujet de thèse
Domaine
Sciences du vivant
Sujets de thèse
Etude du mécanisme de photoactivation de la protéine caroténoïde orange par cristallographie femtoseconde en série résolue dans le temps
Contrat
Thèse
Description de l'offre
La protéine caroténoïde orange (OCP) est une protéine photoactive impliquée dans la photoprotection des cyanobactéries. Récemment, un mécanisme de photoactivation a été proposé, dans lequel l'état S2 initialement excité produit plusieurs états excités caractérisés par des durées de vie distinctes (ICT, S1, S*), mais aucune confirmation structurale n’a pu être apportée à ce jour. Un seul de ces états excités est le précurseur de l'état biologiquement actif de l’OCP, formé à l’échelle de la seconde. Afin de comprendre le mode d’action de l’OCP, nous proposons de la « filmer en pleine action », grâce à la cristallographie résolue en temps. Spécifiquement, nous proposons de caractériser les structures des états intermédiaires formés de l’échelle de la femtoseconde à la milliseconde, en réalisant une expérience de cristallographie résolue en temps ultra-courts. Cette expérience rééquerrera l’utilisation d’un laser à électrons libres (XFEL). Parallèlement, nous utiliserons la nouvelle ligne de lumière ID29 de l’ESRF, dédiée à la cristallographie résolue en temps, pour déterminer les structures des états intermédiaires se formant ultérieurement, de l'échelle de la milliseconde à la seconde. Notre projet de biologie structurale intégrée permettra de visualiser les changements conformationnels subis par l’OCP lors de sa photoactivation, de l'échelle photochimique (centaines de femtosecondes) à l'échelle photobiologique (secondes). Il ouvrira ainsi la voie à une compréhension détaillée du mécanisme de photoactivation et à l’exploitation de l’OCP en optogénétique ou comme « fusible moléculaire » dans les systèmes photosynthétiques biomimétiques.
Université / école doctorale
Chimie et Sciences du Vivant (EDCSV)
Université Grenoble Alpes
Localisation du sujet de thèse
Site
Grenoble
Critères candidat
Formation recommandée
Biophysique ou biologie structurale
Demandeur
Disponibilité du poste
01/10/2024
Personne à contacter par le candidat
Colletier Jacques-Philippe colletier@ibs.fr
CNRS
Institut de Biologie Structurale UMR 5075 UGA,CNRS,CEA
Institut de Biologie Structurale
71 AVENUE DES MARTYRS
38044 GRENOBLE CEDEX 9
0457428515
Tuteur / Responsable de thèse
Colletier Jacques-Philippe colletier@ibs.fr
CNRS
Institut de Biologie Structurale UMR 5075 UGA,CNRS,CEA
Institut de Biologie Structurale
71 AVENUE DES MARTYRS
38044 GRENOBLE CEDEX 9
0457428515
En savoir plus
https://www.ibs.fr/fr/recherche/assemblage-dynamique-et-reactivite/groupe-dynamique-et-cinetique-des-processus-moleculaires-m-weik/snax/article/presentation